斜視眼有家族遺傳性。若調查斜視患兒的家族史，會發現家族成員中患有斜視的人（如兄弟、姊妹、叔伯、姑姨之中）甚多。
關于身體方面的各種缺陷能夠遺傳是眾所周知的事，但這種遺傳基因不盡然都遺傳給每個兒女。兄弟之中可能只有一人患斜視，另一人則眼位端正。這個眼位端正的兄弟結了婚，有了孩子，也可能會有患斜視的子女。斜視眼在家族中遺傳不是全體成員，這種缺陷往往是間接遺傳到下一代子女身上，在遺傳學上對這個問題研究的已經比較清楚了。
電子視力檢測儀廠家認為，如果有眼肌先天性異常，包括眼外肌本身發育異常，中胚葉分化不全，眼肌分離不良，眼肌附著處異常，肌鞘異常及纖維化（如上斜肌腱鞘綜合征）等解剖上的缺陷，或一眼眼肌功能過強，另一組拮抗肌彈性減弱，運動性障礙等，皆可妨障兩眼眼球運動的協調一致，失去兩眼眼位的平衡關系。父母或上代有這些變異和缺陷，其子女也可能繼承下來。如內直肌附著處有異常，就會妨礙眼球運動而形成內斜視。
