健康小屋的使用者通過各種測量設備，雖然可以獲得個人各項生理指標的檢測數據，但對這些科學數據進一步的分析和解讀不夠。其原因主要是健康小屋的初衷之一就是自助化，專業醫務人員的介入不夠，并進而導致使用者對自己健康狀況的認識產生一定的障礙。
解決這個問題有兩條途徑：一是增加醫務人員在健康小屋的的參與度；二是增強系統對健康數據智能解讀的能力。第一條途徑需要人力和財力方面的投入，會加劇社區醫院本來就人員不足的壓力，另外也不符合健康小屋自助化的特點。從長遠來看，第二條途徑是必由之路。
要實現健康小屋的自助化，不僅僅是檢測設備的使用自助化，而且要提高健康數據解讀的自助化，即系統能夠根據體檢數據來進行分析和解讀，這就涉及到了人工智能方面的技術，需要構建專家系統來作為數據分析的基礎。而要構建此類醫學專家系統，又離不開電子健康檔案的標準化。只有在對大量的標準化健康檔案數據進行分析和歸納的基礎上，才有可能形成具有實用價值的健康數據分析邏輯。
